农业航空应用技术部成立于2012年，重点开展大型有人驾驶飞机和无人机精准施药与导航控制技术、航空施药雾滴漂移及沉积模型与规律、航空施药作业效果评价、航空施药专用装备研发及标准规范制定等方面研究与应用示范工作。部门现有专职科研员工17人，其中国家“万人计划”领军人才1名，研究员1名，副研究员5名，助理研究员2名，设计与研发人员8名，在读研究生12名，学科专业涉及农电气化与自动化、计算机应用、机械电子、导航与制导、流体力学、农药学、昆虫学等。
2013年与美国农业部农业服务署作物生产系统研究中心（USDA-ARS-CPSR）、美国农业部农业服务署农业航空应用技术中心（USDA-ARS-AATR）联合成立“中美农业航空联合技术中心”（Sino-US AACTC），2015年被国家科技部认定为“农业航空应用技术国际联合研究研究中心”。分别建设有航空精准施药导航与控制技术实验室、航空定量遥感与专用设备实验室、航空施药喷雾质量检测分析与标准规范实验室、航空施药喷雾建模与动力实验室、农林病虫害监测预警实验室。国际领先的农业航空风洞实验室，具有实验风速6.7～98m/s和3～45.7m/s两座风洞，配备有LaVision高速粒子图像测速系统PIV、Artium相位多普勒测量仪PDI、激光粒度仪、高精度热线风速仪、三维激光扫描仪、半实物飞行仿真平台等先进的测量分析仪器。
航空技术研究团队针对我国航空应用需求开展研究，承担国家和省部级课题26项，研发的航空施药作业监管与计量系统自2013年实现装机以来，累计服务作业面积8900余万亩，覆盖全国12个省、16款有人机/无人机机型；研发的喷雾沉积质量检测分析iDAS系列产品服务全国12家高校和科研机构，并销往澳大利亚、美国；研发的机载精准施药导引与控制系统先后在北大荒通用航空公司、山东瑞达有害生物防控公司等规模化装机应用，是国内首款规模化装机产品，填补国内空白；实现对Thrush 510G、AT802F、R66等多款典型机型的喷雾沉积飘移建模，并在生产作业中发挥作用；研发了多旋翼无人机遥感育种表型信息高通量采集平台及适合无人机搭载的微型OFFNER全反射式成像高光谱仪（AgriHawk），针对美国白蛾、松材线虫、草地贪夜蛾等农林重大病虫害研发形成地面观测网与航空遥感诊断结合的解决方案和应用系统。已发表相关高水平学术论文32篇，国家发明专利申报及授权48项，软件著作权登记89项。
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